微生物組學Microbial Genomics

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    • Sanger測序

      目的菌種基因組DNA使用相應引物(如16S使用27F / 1492R引物),進行擴增。擴增產物利用Sanger法進行測序。測序結果中,原始峰圖文件可使用Chromas軟件查看。該文件經過轉換后方可獲得堿基序列。


    • 樣品拼接后序列堿基組成示例

      各樣品序列格式為fasta格式,如圖2中”>biao1”為樣品名,各樣品名下所列的堿基為各樣品的具體序列。


    • 物種系統進化分析

      將拼接得到的序列與近緣菌株間構建系統進化樹,用于解析菌株之間的進化關系。


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