微生物組學Microbial Genomics

    產品簡介

    擴增子測序是指利用合適的通用引物擴增環境中微生物的16S rDNA/18S rDNA /ITS高變區或功能基因,通過高通量測序技術檢測PCR產物的序列變異和豐度信息,分析該環境下的微生物群落的多樣性和分布規律,以揭示環境樣品中眾多的微生物種類及它們之間的相對豐度和進化關系。

    產品優勢

    • 提取經驗豐富

      土壤(農田土壤、森林土壤等);水體(海水、湖泊水、水庫水等);活性污泥或底泥(海洋沉積物、AMD底泥、熱泉底泥等)等各種環境,數萬例樣品的提取經驗,建立了一系列針對特定環境的手工提取DNA或試劑盒提取DNA的標準方法。

    • 客觀真實

      采用PCR-free建庫方式,避免PCR過程的堿基錯配,真實還原樣本內物種組成信息。

    • 平臺最優

      采用最主流的Illumina HiSeq/Miseq最長測序平臺,可以滿足16S 1~2個高變區的測序分析,成本更低、通量更大、測序質量和拼接效率更高。

    實驗流程

    • 樣品準備

    • DNA提取

    • PCR擴增

    • 文庫制備及庫檢

    • 上機測序

    分析流程


    技術參數

    • 測試策略

      HiSeq2500/Miseq,PE250/PE300

    • 數據量

      3w/5w/10w 條Tags

    • 周期

      35個工作日

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