環境功能基因組Functional Gene Arrays

    產品簡介

    PathoChip是周集中教授及其團隊于2013年成功研發的針對病原微生物的功能基因芯片,用于檢測多種環境當中病原以及與致病相關的微生物群落的功能組成和結構,進而探討和評估威脅人類和動植物健康的微生物群落的致病潛能。
    該芯片針對16,762個確認的致病和毒性相關基因序列,共設計了3,715個探針,特異性檢測1,397個病原微生物物種(2,336個菌株)中7,417個蛋白編碼序列,共涵蓋了13個關鍵的致病和毒性因子。

    產品優勢

    • 數據可讀性強

      與基于測序的宏基因組數據相比,GeoChip數據簡單易懂,可直接用于各類統計分析,有助于結果的解讀和比較

    • 靈敏度和可靠性高

      該芯片已對土壤、海水和人體唾液樣品進行了實驗測試,結果表明,平行樣品間結果具有很高重現性

    • 宿主基因組的干擾少

      PathoChip芯片是根據病原微生物相關的各類功能基因設計的特異性探針,可專一地檢測單個特定的功能(序列)

    • 檢測類群廣

      PathoChip芯片所針對的病原微生物群落功能十分全面,包括了如附著、定植、遷移、入侵、毒性、免疫逃脫和鐵離子攝取等相關的多種病原微生物

    實驗流程

    • 樣品采集

    • 核酸(DNA/RNA)提取

    • 核酸檢測

    • 熒光標記

    • 芯片雜交

    • 芯片掃描與成像

    分析流程

    技術參數

    • 測試策略

      DNA或cDNA

      RNA

    • 數據量

      60K/180K

      60K/180K

    • 周期

      55個工作日

      65個工作日

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