環境功能基因組Functional Gene Arrays

    產品簡介

    周集中教授及其團隊研發于2012年成功研發了微生物群落對環境變化響應的功能基因芯片StressChip,用于檢測人工系統和自然生境中環境條件的改變對微生物群落功能組成和功能的影響,進而探討微生物群落對環境脅迫的響應。
    該芯片針對46個明確的功能基因,共設計了22,855個探針,特異性檢測985個細菌、76個古菌和59個真菌物種(或菌株)中79,628個蛋白編碼序列,涵蓋了微生物對溫度、滲透壓、氧梯度、營養缺乏等多種環境變化的響應。

    產品優勢

    • 有效性高

      通過對宏基因組數據的計算機驗證分析表明,該芯片能清晰反映各脅迫基因在各自生境中的種類和豐度分布,展示了該芯片的有效性

    • 數據可讀性強

      與基于測序的宏基因組數據相比,GeoChip數據簡單易懂,可直接用于各類統計分析,有助于結果的解讀和比較

    實驗流程

    • 樣品采集

    • 核酸(DNA/RNA)提取

    • 核酸檢測

    • 熒光標記

    • 芯片雜交

    • 芯片掃描與成像

    分析流程

    技術參數

    • 測試策略

      DNA或cDNA

      RNA

    • 數據量

      60K/180K

      60K/180K

    • 周期

      55個工作日

      65個工作日

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