微生物組學Microbial Genomics

    產品簡介

    細菌全基因組De novo測序也叫細菌全基因組從頭測序,指不依賴于任何參考序列信息就可對某種細菌進行測序,然后用生物信息學的方法進行序列拼接、組裝,從而獲得該物種的基因組序列圖譜,并對其進行結構和功能等一系列的分析。依據研究目標所需精細程度的不同, 我們提供了細菌框架圖和細菌完成圖兩種不同的解決方案。

    產品優勢

    • 項目周期短

      擁有標準化操作實驗室和高通量測序技術平臺,可以快速拿到高質量測序結果

    • 測序平臺齊全

      擁有多種測序平臺,提供最佳的測序解決方案。

    • 分析經驗豐富

      擁有專業的生物信息團隊和大型計算機,個性化售后分析服務

    實驗流程

    • 樣品采集

    • DNA提取檢測

    • 文庫構建

    • 文庫質檢

    • 上機測序

    分析流程

    技術參數

    • 測試策略


      細菌/古菌框架圖:HiSeq PE150(350bp文庫)

      細菌/古菌精細圖:HiSeq PE250(500bp文庫)

      細菌/古菌完成圖:PacBio RS II(10kb SMRT文庫)






    • 數據量

      細菌/古菌框架圖:≥100×

      細菌/古菌精細圖:≥100×

      細菌/古菌完成圖:≥50×




    • 周期

      細菌/古菌框架圖:30個工作日

      細菌/古菌精細圖:45個工作日

      細菌/古菌完成圖:60個工作日


    • 指標

      細菌/古菌框架圖:無

      細菌/古菌精細圖:≤30 scaffolds

      細菌/古菌完成圖:1contig,0 Gap

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